Το ΤΧΣ έχει υπό την επίβλεψη του τις 4 συστημικές τράπεζες όπως αυτές προσδιορίζονται μέσω των Συμφωνιών Πλαισίου που έχουν υπογραφεί με την κάθε τράπεζα ξεχωριστά και σήμερα είναι ο μεγαλύτερος μέτοχος σε δύο από τις τέσσερις συστημικές τράπεζες. Με στοιχεία 3ου τριμήνου του 2020, το ΤΧΣ διατηρεί τις ακόλουθες συμμετοχές σε καθεμία από τις τέσσερις συστημικές τράπεζες:
- Εθνική Τράπεζα της Ελλάδος: 40.4%
- Τράπεζα Πειραιώς: 26.4%
- Alpha Bank: 10.96%
- Eurobank: 1.40%